事业单位工资改革面临四大技术难题：一是工资结构设计如何兼顾公平与激励，确保不同岗位、职级间的合理差异；二是绩效评估体系如何科学量化，避免主观性影响考核结果；三是财政承受能力与薪酬增长的平衡，需在预算约束下实现动态调整；四是历史遗留问题处理，如新旧制度衔接与离退休人员待遇衔接。这些难题直接关系到改革成效与人员稳定性，需通过精细化测算与渐进式改革破解。