ContigExpress是一款专为测序结果设计的序列拼接软件，主要用于将高通量测序产生的短读长序列（如Illumina、IonTorrent等平台的数据）高效拼接成更长的连续序列（Contigs）。该软件通过优化算法处理大规模测序数据，支持多种文件格式输入（如FASTQ、FASTA），并提供可视化界面帮助用户分析拼接结果。ContigExpress具备以下核心功能：1.**高效拼接**：采用重叠-布局-共识（Overlap-Layout-Consensus,OLC）或deBruijn图算法，快速组装短读长序列。2.**质量控制**：内置质量过滤模块，可去除低质量读段或接头污染，提升拼接准确性。3.**多平台兼容**：支持Illumina、PacBio、Nanopore等主流测序平台数据。4.**可视化分析**：提供图形化界面展示Contig长度分布、覆盖度及一致性评估，辅助结果验证。5.**扩展工具**：集成序列比对、变异检测等功能，适用于基因组从头组装或转录组分析。适用于微生物基因组、宏基因组及小型真核生物测序项目，是生物信息学研究和临床诊断的实用工具。
