保护碱基（ProtectiveBases）是在DNA合成或分子生物学实验中添加到引物或寡核苷酸序列两端的额外碱基。它们的主要作用是提高合成效率、防止核酸外切酶降解或优化后续实验步骤（如限制性酶切）。保护碱基通常不参与目标序列的配对或功能，但在特定实验条件下能增强稳定性和成功率。常见于PCR引物设计、克隆和测序等应用中。