工程合作合同协议书是合作双方为明确各自权利、义务及责任而签订的法律文件。该协议详细规定了合作项目的范围、工期、质量标准、付款方式、违约责任等关键条款，确保双方在项目实施过程中有据可依。通过签署此协议，双方建立正式合作关系，共同遵守约定条款，保障工程顺利实施并维护各自的合法权益。