学校卫生监督检查内容主要包括以下几个方面：一是学校环境卫生，检查校园内外的清洁状况、垃圾处理、厕所卫生等；二是食品安全，检查食堂卫生条件、食品储存、加工流程及从业人员健康证等；三是饮用水卫生，检查水质检测报告、供水设施清洁及消毒情况；四是传染病防控，检查晨检记录、因病缺勤追踪及消毒措施落实情况；五是教学环境卫生，检查教室采光、照明、课桌椅配置及通风情况；六是宿舍卫生，检查宿舍内务、通风及公共区域清洁情况；七是健康教育，检查健康课程设置及宣传活动开展情况。