Cytoscape是一款开源的网络可视化与分析软件，主要用于生物分子相互作用网络、蛋白质相互作用网络等复杂生物数据的可视化分析。它支持多种数据格式导入，提供丰富的布局算法和可视化选项，帮助研究人员直观地探索和分析网络数据。Cytoscape的核心功能包括：1.网络构建与可视化：支持从多种数据源构建网络，并提供多种布局算法调整网络显示。2.数据分析：内置多种网络分析工具，如网络拓扑分析、模块识别等。3.插件扩展：通过插件系统可扩展功能，已有大量生物信息学相关插件可供选择。4.数据整合：支持将网络数据与基因表达等属性数据整合分析。该软件广泛应用于系统生物学、药物开发、基因组学等领域，特别适合需要可视化复杂网络关系的研究场景。最新版本提供了更友好的用户界面和更强大的分析功能，建议访问官网获取详细文档和教程。
