质粒DNA电泳通常会出现三条带，分别代表不同的DNA构型。这三条带从上到下依次是：开环DNA（松弛型）、线性DNA和超螺旋DNA（共价闭合环状）。开环DNA由于结构松散，迁移速度最慢，位于最上方；线性DNA由于结构规则，迁移速度适中，位于中间；超螺旋DNA由于结构紧密，迁移速度最快，位于最下方。这三条带的出现可以帮助研究人员判断质粒DNA的完整性和纯度。