转录起始位点(TranscriptionStartSite,TSS)的测定是分子生物学和基因组学研究中的重要环节,用于确定基因转录的精确起始位置。TSS的定位对于理解基因表达调控机制、启动子结构以及转录因子结合位点的功能至关重要。测定TSS的常用方法包括:1.**5'RACE(RapidAmplificationofcDNAEnds)**:通过逆转录和PCR扩增cDNA的5'端,结合测序技术确定TSS。2.**CapAnalysisGeneExpression(CAGE)**:利用5'端帽子结构捕获技术,结合高通量测序,在全基因组范围内鉴定TSS。3.**RNA-seq(RNA测序)**:通过分析RNA测序数据中的5'端富集信号,推断TSS位置。4.**PrimerExtension**:使用放射性或荧光标记的引物延伸至mRNA的5'端,通过电泳确定TSS。5.**Oligo-capping**:通过酶法去除mRNA的5'端非帽子结构,再连接特定寡核苷酸,辅助TSS鉴定。这些方法各有优缺点,适用于不同研究需求。准确的TSS测定有助于解析基因调控网络,并为疾病相关突变和表观遗传修饰的研究提供重要信息。
