基因工程药物的发展为人类健康带来了革命性的突破，能够治疗传统药物难以应对的疾病。然而，这一技术的应用也引发了一系列伦理学争议。首先，基因改造可能带来不可预见的长期副作用，对人类基因库的影响尚不明确。其次，高昂的研发成本导致药物价格昂贵，可能加剧医疗资源分配不公。此外，基因增强技术的应用可能引发"设计婴儿"等优生学争议，挑战人类自然进化的界限。动物实验的伦理问题、个人基因隐私保护以及技术可能被滥用的风险，都是需要深入探讨的伦理议题。如何在科技创新与伦理约束之间取得平衡，成为基因工程药物发展中亟待解决的重要问题。
