Popgene软件是一款用于群体遗传学数据分析的实用工具，主要用于计算和分析群体遗传多样性、遗传结构以及基因流等参数。该软件由加拿大阿尔伯塔大学开发，适用于Windows操作系统，界面简洁，操作方便。Popgene支持多种数据类型，包括等位基因频率、基因型数据等，能够计算常见的群体遗传学指标，如等位基因频率、观察杂合度（Ho）、期望杂合度（He）、多态信息含量（PIC）、固定指数（Fst）等。此外，它还提供遗传距离计算、分子方差分析（AMOVA）以及基因流（Nm）估计等功能。该软件广泛应用于生态学、进化生物学、保护遗传学等领域的研究，特别适合处理微卫星（SSR）和单核苷酸多态性（SNP）等分子标记数据。虽然界面较为简单，但功能全面，是群体遗传学研究的常用工具之一。注意：由于开发时间较早，Popgene可能不支持最新的大型数据集或某些复杂分析，建议结合其他软件（如GenAlEx、Arlequin等）使用以获得更全面的分析结果。
