游艇码头设计应充分考虑环境保护和生态平衡。在选址和布局阶段，需评估对周边水域生态的影响，避免破坏红树林、珊瑚礁等敏感区域。码头结构宜采用环保材料，减少对水质的污染。同时应设置油污收集装置和垃圾分类设施，防止油污和垃圾进入水域。设计还需考虑船舶尾气排放控制，鼓励使用清洁能源。在照明设计上，应采用防眩光灯具，减少对周边生态环境的光污染。码头运营后应建立定期环境监测机制，确保符合环保要求。